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LncRNA(Long non-coding RNA),即长链非编码RNA,是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA分子。尽管它们不直接编码蛋白质,但在多种层面上(如表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)对蛋白编码基因起调控作用1。近年来,随着研究的深入,LncRNA的分子机制逐渐得到揭示。
首先,LncRNA在细胞中具有多种功能。它们可以参与转录调控、转录后调控以及染色体沉默、基因组印记、染色质修饰等多种重要的调控过程。例如,某些LncRNA能够招募染色质重构和修饰复合体到特定位点,改变DNA/RNA甲基化状态、染色体结构和修饰状态,进而控制相关基因的表达。
其次,LncRNA的功能机制多种多样。它们可以作为RNA诱饵,结合转录因子,干扰其与基因promoter区域的结合,从而调控转录;也可以作为分子海绵,吸附miRNA,抑制其与mRNA的结合,使得mRNA免于降解;此外,LncRNA还可以作为蛋白互作的支架或桥梁,影响蛋白多聚物的形成,调控蛋白活性;或者招募染色质修饰因子,改变染色体的修饰水平,从而影响基因的转录和表达。
在研究方法上,针对LncRNA的分子机制研究,可以采用多种技术。例如,通过芯片或RNA测序等方法对疾病模型和对照样本组织进行LncRNA表达谱分析,从而筛选出具有表达差异的LncRNA;然后,通过PCR或Northern Blot技术对候选LncRNA进行验证,确定其表达差异;进一步,还可以利用荧光原位杂交技术(FISH)或RNA Scope技术等确定LncRNA在细胞中的定位,以便更好地理解其功能。
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