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乙型肝炎病毒cccDNA检测方法及应用价值
在乙肝病毒的复制过程中,病毒DNA进入宿主细胞核,在DNA聚合酶的作用下,两条链的缺口均被补齐,形成超螺旋的共价、闭合、环状DNA分子(covalently closed circularDNA,cccDNA)。细胞外乙型肝炎病毒DNA是一种松弛环状的双链DNA(relaxed circularDNA,rcDNA)分子。cccDNA是乙肝病毒前基因组RNA复制的原始模板,虽然其含量较少,每个肝细胞内只有约5~50个拷贝,但对乙肝病毒的复制以及感染状态的建立具有十分重要的意义,只有**了细胞核内的cccDNA,才能消除乙肝患者病毒携带状态,是抗病毒**的目标。
细胞外乙型肝炎病毒DNA是一种松弛环状的双链DNA(relaxed circularDNA,rcDNA)分子,其两条链均不是闭合的,其中负链较长,约3200个碱基,含有乙肝病毒基因组的全长基因,在其5’起始端与3’末端之间有一个数个碱基的“缺刻”(nick);正链较短,有较大的“缺口”(gap),其3’末端不固定,故长度是可变的,约为负链长度的50%~。在乙肝病毒的复制过程中,病毒DNA进入宿主细胞核,在DNA聚合酶的作用下,两条链的缺口均被补齐,形成超螺旋的共价、闭合、环状DNA分子(covalently closed circularDNA,cccDNA)。cccDNA是乙肝病毒前基因组RNA复制的原始模板,虽然其含量较少,每个肝细胞内只有约5~50个拷贝,但对乙肝病毒的复制以及感染状态的建立具有十分重要的意义,只有**了细胞核内的cccDNA,才能消除乙肝患者病毒携带状态,是抗病毒**的目标。
cccDNA和rcDNA在结构和理化特性上有三点不同:①rcDNA在正链与负链上均有缺口或缺刻,只是部分区域互补故能形成环状结构,但非超螺旋结构;而cccDNA两条链均是完整的,二者共价互补,形成超螺旋结构。②rcDNA能与蛋白质共价结合,cccDNA则不能。③由于缺口或缺刻的存在,rcDNA可以被一些核酸酶如外切核酸酶Ⅲ(exonuclease Ⅲ)、绿豆核酸酶(mung beannuclease)等降解成寡核苷酸或单核苷酸,而cccDNA则由于是超螺旋且双链结构均是完整的,一般不会被上述酶降解。上述差异是设计和建立cccDNA检测技术的基础。