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STR分型服务
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STR分型服务
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STR分型服务
达为科优势
  • 客户只需提供待测的样本和待测基因STR位点,我们可为您设计实验方案。
  • 利用DNA测序仪对片段进行荧光标记,加上分子量内标进行DNA片段分析,可以使STR分型变得异常高效快捷,结果更加精确。
  • 如果研究的位点较多,为了节约您的成本,我们一个泳道可以同时检测三种不同的荧光。
  • 我们可提供从微卫星序列筛选、引物设计鉴定、PCR直至数据处理分析的全套服务。
  • 协助客户进行微卫星位点的选择:由于只有杂合子的微卫星位点可以提供有效的信息,因此在选取微卫星标记时,一定要选取杂合度高的位点。
原理
短片段重复序列(short tandem repeat, STR)是由2 - 6个碱基对作为核心单位,串联重复形成的一类DNA序列,由于核心单位重复数目在个体间呈高度变异性并且数量丰富,构成了STR基因座的遗传多态性。它分布于人类整个基因组,平均每15 kb就存在一个STR基因座。人类基因组内已发现了七千个以上的STR位点。它具有分布广泛,易于检测,信息量大,有高度多态性并遵循孟德尔共显性遗传等优点。目前STR分析已广泛应用于遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等诸多领域。
服务流程


客户提供

1.如果提供基因组DNA:至少提供100 ng DNA样品(针对每个多态性位点,需样品3-5 ul,浓度为30 - 50 ng/ul);提供样品类型,DNA溶液浓度和纯度值,以及可能残留的抑制剂成分。样品蕞好溶解在ddH2O中,如果不是,请写明溶解液成分。

2.如果提供PCR产物:产物要通过预实验的电泳检测,特异性要好

3.如果需要设计引物,请提供目的片段序列或者微卫星检测位点,引物设计好后需要客户确认。


确定STR位点,设计实验方案,包括荧光标记的选择,引物的设计、合成和标记,荧光分子量内标的选用等等。

按照所设计的实验方案完成荧光PCR,利用琼脂糖电泳检测结果;若PCR产物特异性不够,将进行优化。

PCR产物通过测序仪器电泳检测,获得扩增片段大小的数据

用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等软件对收集到的数据进行处理分析,将产物片段大小、数量多少的信息转化成直观准确的波形图谱,为下一步进行关联分析或连锁分析等遗传分析提供可靠的数据。

我们提供:微卫星座位PCR产物全自动检测及分型结果



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