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全基因组甲基化测序(WGBS)
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全基因组甲基化测序(WGBS)
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全基因组甲基化测序(WGBS)
WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing)被视为甲基化测序的“金标准”。其原理是用Bisulfite处理,将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来,再结合高通量测序技术,与参考序列比对,即可判断CpG/CHG/CHH位点是否发生甲基化,特别适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。
项目流程
标准数据分析
  • 数据质控
  • 产出统计
  • 比对参考基因组
  • Reads在基因功能元件上的分布
高级数据分析
  • 测序深度统计
  • 基因组覆盖度统计
  • C、CG、CHG和CHH平均甲基化水平计算
  • 全基因组甲基化水平分布趋势分析
  • 各条染色体甲基化水平统计
  • 不同基因区域甲基化水平统计
  • 不同基因元件甲基化水平统计
  • 甲基化Motif序列特征分析
  • 全基因组DNA甲基化图谱
  • 差异性甲基化区域(DMR)分析
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