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lncRNA分子机制研究
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lncRNA分子机制研究
LncRNA (Long noncoding RNAs, LncRNAs) 长链非编码RNA, 起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究表明,LncRNA参与了X染色体沉默(图A),基因组印记以及染色质修饰,转录激活(图B),转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,LncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。
哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA(相应的蛋白编码RNA的比例是1%),虽然近年来关于LncRNA的研究进展迅猛,但是绝大部分LncRNA的功能仍不清楚,随着研究的推进,各类 LncRNA 的大量发现,LncRNA 的研究将是 RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向,使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。
LncRNA的调控机制研究包括
  • A、表观遗传研究-DNA甲基化:利用MSP、BSP技术,研究LncRNA对DNA甲基化的调控。
  • 表观遗传研究-染色质重塑:利用ChIP技术,研究LncRNA对染色质重塑的调控。
  • 转录调控研究:通过EMSA、RIP(下图所示)、ChIRP、Co-IP等技术,研究LncRNA与转录因子间的相互作用。
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