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miRNA功能预测的数据分析
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达为科优势
  • 系统直观地得到核心调控microRNA得到受多个microRNA调控的重要靶基因
原理
miRNA与对应的靶基因存在负调控关系,因此可以将表达谱分析得到的差异基因与miRNA靶基因取交集后对miRNA做负相关分析,在构建靶基因之间的调控关系网络后,加入对应miRNA对靶基因的调控关系,从而方便地研究miRNA对整个靶基因信号转导流程的转录后调控过程。
服务流程
  • 筛选差异基因。
  • 通过TargetScan的方法预测MicroRNA的靶基因,得到差异MicroRNA能够调控的靶基因。
  • 根据差异基因和差异MicroRNA的数据作MicroRNA-mRNA的负相关分析,得到和差异MicroRNA表达趋势相反的靶基因。
  • 对上一步得到的靶基因进行功能分析,得到可靠的、显著性的、靶向的基因功能。
  • 根据靶基因功能的分析结果,构建基因功能之间相互作用的网络。(GO-Map)
  • 对靶基因进行显著性信号通路分析,得到靶基因参与的准确的、可靠的、显著的信号通路。(Pathway-Analysis)
  • 根据显著性信号通路的分析结果,构建显著性信号通路的网络,从中发现上游信号通路、**信号通路和下游效应信号通路。(Path-Net)
  • 对显著性功能结果和显著性信号通路结果中包含的靶基因取交集,得到交集靶基因。
  • 根据MicroRNA-靶基因的关系,构建MicroRNA调控交集靶基因的网络,从中发现调控能力强的MicroRNA以及被调控的多的靶基因。(MicroRNA-Gene-Net)
  • 基于靶基因的显著性功能分析,构建MicroRNA与交集靶基因功能的网络,从中发现调控能力强的MicroRNA和受调控多的基因功能。(MicroRNA-GO-Network)
服务流程
步骤
客户提供
服务内容
诺百提供
1 1、目的miRNA信息;2、靶细胞及相关信息;靶蛋白抗体(如果需要)及其他生物学功能分析相关信息及材料 设计、合成Pre-miR miRNA模拟物或miRNA抑制剂
2
(方案一)质粒构建,转染细胞。 质粒测序报告

(方案二)慢病毒包装,侵染细胞 慢病毒液(1E6 – 1E7 TU/ml);病毒滴度数据

(方案三)腺病毒包装,侵染细胞 腺病毒液(1E8 – 1E9 pfu/ml);病毒滴度数据
3
TaqMan探针检测靶基因表达水平的变化 检测报告
4 可用的靶蛋白抗体 **学方法检测靶蛋白表达水平的变化 检测报告
注意:此项目在步骤1启动。客户可根据具体需求选择感兴趣的方案作为步骤2。同时,客户可指定项目在哪一步终止。
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